在【墨菲斯】二代的开发过程中，研究员们同样遇到过艰难考验。
最高决策层希望能在初代的基础上增补功能模块、提高精度，同时占地面积缩小一半以上。听到这些要求后，大家都感到“绝望”。
方岐想到一个点子，利用家庭中央电脑分担【墨菲斯】部分计算任务，尤其是因为在睡眠时家庭电脑大多闲置，有充足的计算空间；而且可以借此使【墨菲斯】二代融入智能家居网络，以便协同调控家庭内部其他电子设备的使用，自动减少使用期间的电磁干扰。方岐为了证明可行性，私下与师铎、葛彩芽花了十多天设计出了全套的规划方案，包括线路图纸和难度分析等等。
没想到自信满满地向上面提交后，立即遭到否决，主要因为一旦连通家用电脑保密性必然会大大削弱。
方岐显然受到了不小的打击，不过第二天却意外地获得了单独面见监察委员会委员长的机会。
出发前有人告诉他：到时候少说话。
监察长的短发乌黑硬挺，左眼睑之上挂有一块不规则的伤疤。年纪已经接近七十，乍看上去却不过四五十岁。他泰然坐在椅子上，整个谈话期间，躯干仿佛纹丝未动，不怒自威。
眼神交汇的一瞬间，方岐被震慑到，扑通一下撞歪座椅，不小心发出巨大的声响，在空荡的会议室里回响。
“不好意思。”方岐难掩慌张的神情。
“不要紧张。”监察长嘴角稍稍上翘，似是微笑。
方岐收起下巴，端正身姿，舔过嘴唇，快速地点头。
“我常常看见你呀。在录像里或者是……嗯……新闻发布会上。你的工作做得都挺好，人也长得挺帅，哈哈哈。”
方岐“用力”地试图露出笑容，实际上却显得尴尬。监察长的笑声反而更大了。
“哼哧哼哧。”他的鼻腔中发出浑厚的共鸣音。“今天找你来主要是有两点。一是想亲眼见见你，二是……我觉得你的思想方面，一直有点问题。”监察长第一次抬起手臂，伸出食指。
方岐下意识地点头。
“你的那个电脑的方案，我也看了，其实是可行的，还有很多顾问都这么觉得，而且能降低成本。那么你们王组长应该也告诉你了，问题就在于这个数据的保密性，控制不了。这是致命伤。
“……
“你们组里的诸葛双树,他的出身背景不一般。他父亲是东北人，母亲是台日混血儿……算了，总之他这个人在思想方面，从小就没有‘我是华夏国人’的，这样一种认同感，但是我们还是要在名义上重用他，甚至把他放入核心小组。
”为什么啊？就是因为需要他的加密算法。我知道你小子老是在想什么,什么开放平台啊，共同开发造福全人类啊。难道我们就没想过吗？我们这些人就没有人性吗？你考虑过的问题我们都考虑过，我们在考虑的深层次的问题，是你没想到的。你知道利、日为什么不对外公布apx系统的开发进展吗？还有印度。利坚国印度现在国内压力都非常之大。”
方岐没有问apx系统是什么，只是说：“不知道。”
“【墨菲斯】的科技水平，是利日等国五年甚至十年内都无法超越的。
“总参三部确认，多股间谍人员已经渗透至我们内部，向境外泄露研发进度甚至是核心机密。利日至今默不作声，是因为，他们自以为尚未被我们发现。默不作声，是为了防止我们提高警惕，还妄想继续地窃取关键资料。
“人类是不会灭亡的，因为有【墨菲斯】。至少华夏国人，或者各国的精英们不会灭亡，我们可以保证这一点。你应该清楚，每个人的一生都会经历痛苦折磨，人类这一物种的命运也是。”
方岐听到这里仿佛忘却了呼吸。
“如果这场灾难是【墨菲斯】所无法抵挡的，那么我们公布与否，不会影响最终结果。
“现在来看，【墨菲斯】的进展足以应对可见的困境，假如实在困难，我们还可以转战地下，但中、利两个超级大国的竞争却永远不会消失。
“你看看现在，我们的中产阶级、甚至低产阶级，生活中什么都要和利坚国比，和唐朝比；而利坚国近期对我们的贸易、金融、军事、网络的对抗又在不断升级。尤其是互联网，在这个时代，互联网已经控制了百分之八十的智能化电子产品，而我们长期以来处于一成不变的劣势。
”我们现在甚至都没法预估：利坚国网军，如果侵入我们的金融主干网需要多长时间？哪怕只入侵电力系统的某个一级子网，我们一旦防御失败，比如华东区或者上海电力瘫痪了，那对我们都是半毁灭性的打击。除了核武，我们没有还手之力。政府目前已经无法即时切断国内与因特网相连的根线路，而我们的网络武器在利军看来统统是小儿把戏，因为这东西本来就完完全全是人家发明出来的，你又怎么可能玩得过他？
“而现在，【墨菲斯】就是我们一百多年来都期盼的一个真正意义上的转折点，可以实现超车的弯道。我们无意称霸，更不想以此控制利坚国控制世界，但华夏国人也不能甘心屈居第二或者是忍受国家命脉被他国控制。华夏国在几千年的时间里都是毫无疑问的超级大国，这不是党组织或者某一国家领导人决定的，这是我们的民族尊严，十几亿人民的精神需求决定的。我们并不是利用这次天灾，发灾祸财，而是在这场灾祸下我们理所当然要首先保证自己的族人能够有机会活下来。我们只是希望卖一台给外国人，拿到的钱足够救更多的国人。
“不然反过来，假如利坚国人掌握了【墨菲斯】，难道他们会先来救我们吗？
“……”
方岐被深深地震撼了。一股激流从尾椎骨沿着脊椎蹿升至头顶，他感到头皮都麻了，手臂不停地颤抖。
改进电磁屏蔽方案、优化客户机结构、升级数据处理设备，在核心成员的共同努力下，【墨菲斯】二代的占地空间有望降低至目标要求。
九月下旬第一批试验机型诞生。
原本在将近九个月的经验累积以及大数据分析后，科研人员很有信心在初代基础上进一步提高精度，没想到研测试结果却显示开了倒车。
考虑到时间紧迫，接下来的任务不得有失，王惠成和周若眉决定再次将核心小组一分为二，一边由王惠成、童秩迪带领，负责数量浩繁的控制程序，逆向校验整个体积优化过程；另一边由周若眉与龙哲飞带领，尝试一套全新的解决方案。两边都立下军令状，要在十一月底完成基本目标。
龙哲飞提出的新方案是，首先将目标人群分为“惯用左手者”与“惯用右手者”（即左右撇子），然后由所属医学测量组做更加精的细脑部特征图绘制，最终外机组工作人员将对每位使用者定制升级版头盔，同时大量减少纳米探针与电极数目。十一月到了上旬，此方案渐渐成型。虽然王惠成组也取得了不错的进展，但大部分人都开始意识到，小龙创新性的构想很有希望大跨度地拔高【墨菲斯】整体的诊疗质量，应当成为未来的发展方向。
可是，个人化定制需要大量的预备工作，原本已经完成的混合特征脑模型库又必须重新维护，而且急需各个方面的人才，因此，大部分研发人员被调入龙哲飞组。终于，在十二月下旬，新一代定制化方案终于设计完成并通过审核测试，成果喜人。另一方面，靛青区数据传输基站的调整接合工作也顺利完成，真正意义上功能完整的【墨菲斯】二代马上就要投产了。
然而计划又意外地宣告紧急停止。
不过，这次的暂停的原因却大大有利于【墨菲斯】销量的提升。
2036年12月20日晚，挪威一对老夫妇正收拾行李打算搬家，因为受不了脾气暴躁的邻居——34岁的西格蒙德——长期的大吵大闹。
可是，第二天清晨却发现噪音突然彻底消失了。接着一连两天西格蒙德家都毫无声响，寂静的像半世纪前的郊外。
因为知道西格蒙德有服用毒品的习惯，担心他出事，老头子拖着行李箱去敲门，却也无人应答，后来发现西格蒙德果真独自死于家中，体形瘦消、面容狰狞。
法医鉴定，西格蒙德体表无明显伤痕，体内有微量毒品成分残留。但蹊跷的是，死者既非精神错乱后自杀，亦非服用毒品或麻醉药物过量而亡。警察在他的家中搜查出两瓶打碎的吗啡注射瓶，瓶口均未开封，液体洒在地板上。询问过其友人，法医判断西格蒙德生前很可能患有辐射病。而辐射病专家表示，受异常辐射影响而病变的患者，除了重度失眠外，多数可产生强烈幻觉，尤其是突然停药的瘾君子。
据此警方推测，事发前几天，西格蒙德在家中试图自行戒毒，情绪亢奋。20日当晚，毒瘾再次发作，伴随着因辐射病变而产生强烈幻觉，使他痛苦不堪，混乱之下失手打碎了预留的镇静剂，继而精神压力过大导致猝死。
此后，国际卫生组织将因异常太阳辐射引发的精神类疾病统称为“西格蒙德综合症”（之前被人们叫做“阳光辐射病”）。而西格蒙德被确诊为首个“西格蒙德综合症”病理性致死病例。此事成为了轰动的新闻，引起人们注意的主要有两点：一是西格蒙德病死于时值极夜的北欧，太阳辐射并不强烈；二是验证了毒品或镇静类药物与“西格蒙德综合症”间的可怕关联。
不久全球性大规模疫情开始爆发，越来越多主流宗教家宣称这是来自神明的末日审判。
为此黛赭区暂停生产计划，对全球类似病例进行仔细分析，调整了【墨菲斯】二代的部分配置，推迟至2037年2月发售。加之美国政府的种种阻碍，使得一直到4月份，也就是在apx系统发售一个多月后，【墨菲斯】二代才得以进入北美市场。由于难以铺设新的通信网路，欧洲地区更是拖延至6月，二代的后台服务系统升级后才得以首次运行。
这些因素暂时影响了上半年二代的销量，风头一度被apx盖过。
但由于个人化定制的诊疗效果升级，外加星海公司宣布召回2036年发售的150万台初代产品，并全部免费升级至第二代，使得【墨菲斯】如日中天，毫无疑问地夺回了市场龙头宝座。